有責配偶者からの協議離婚

（1）に関してですが，既に不貞の相手方から９００万円の支払いを受けているのであれば，損害が填補されているともいえますので，請求が難しくなる可能性もあります。不貞行為は，共同不法行為となるため，配偶者と不貞の相手方のどちらかから支払いを受けている場合には，他方への請求は困難です。
（２）に関してですが，双方の収入や生活状況からするとご指摘のとおり，貯金が０円ということに疑問を持つことは当然かと思います。相手方の通帳等の開示を受け，婚姻生活において不必要かつ不相当な支出については浪費として請求していくことになるかと思います。認められるかどうかは，立証の問題もありますので，お答えが難しいところです。

（１）について。
不貞行為については既に不貞相手と示談済なのですから、再度の不貞行為がない限り、それで決着が付いているとされる可能性が高いですね。
（２）について。
浪費が証明されても、それだけで損害賠償できるかは微妙だと思います。預貯金がゼロというのなら、全ての口座を開示するよう求めて、証明するよう申し入れるとか、銀行名・支店名まで分かれば、裁判所の送付嘱託などを利用して履歴を出させる等の手段で対抗することは考えられます。

ただ、相手方が離婚を希望しているのであれば、解決金をいくら払えば離婚してやるという主張は可能なので、そのような戦い方を考えて見るのも一つかもしれません。
できれば弁護士さんと一緒にやる方が良いでしょうね。

特に（2）に関して認められるものなのでしょうか？

立証できないと難しいでしょうし、立証できても夫婦関係が破たん後に奥さんが持ち出したことを持って、奥さんへの財産分与での請求という構成になるかと思います。
自由意思で奥さんが使っている以上、相手の不法行為などと構成するのは難しいでしょう。

特に（2）に関して認められるものなのでしょうか？

立証できないと難しいでしょうし、立証できても夫婦関係が破たん後に奥さんが持ち出したことを持って、奥さんへの財産分与での請求という構成になるかと思います。
自由意思で奥さんが使っている以上、相手の不法行為などと構成するのは難しいでしょう。