刑事告訴と労働問題についての質問です。

個人クリニックの看護師として働いています。
電子カルテのパソコンからネットに接続し、いろんなサイトを見ていました。
私を含め看護師全員(5人)です。
ただ私は仕事で使う資料だけではなく、私的なプリントを200枚程してしまい、会社のファイルに入れて保管。
そのままゴミ箱にすててしまい器物破損、隠蔽工作と言われてしまいました。
他にも携帯を会社のWi-Fiルーターに無断で接続したり、携帯の充電をしてしまいました。

今回、コピー(印刷)代が先月より10000円程高いと言われ、私は仕事の資料の印刷を大量にしてしまった後だったので、急いでその資料とともに院長に報告しました。
翌日、「どうしてこれが印刷できたのか？」という話から、電子カルテのパソコンでネットを使用していた事が大問題となりました。
幸い情報漏洩はありませんでしたが、看護師全員インシデントを書き、院長に提出し、「今後インターネットにアクセスできない様する」と言われ、デスクトップからInternet Explorerがリモートで消去されました。
後日、私と22歳の看護師(Aさん)だけが院長と副院長に呼ばれ、パソコンを不正に使用した事に対する念書2枚と「今後故意に破損したり、不穏な事があれば即解雇、刑事告訴する。但し半年間の猶予あり。」と書かれた書類にサインさせられました。
ただ、その時「あなたパソコンでハリーポッターと音楽聴いていたでしょ。Aさんもあなたが見たって言ってたし、他の人もみんなそう証言している」と副院長にいわれましたが、全く身に覚えがなかった為、その念書には、サインしませんでした。
翌日、Aさんが副院長に呼ばれ2人で話をした後、今度は三人で話した後からAさんは私を避ける様になりました。
数日経ち、Aさんが私に「この間奥様(副院長)にあの人と関わるとろくな事がないから関わらないようにいわれた。あと、辞めた人達もあの人はろくな人じゃないし、薬を盗むのを止めても辞めなかった。私も100万する薬を盗もうとした所を見た事がある。他の人にも言ったからあなたも関わらないように」と言われたと教えてくれました。
もちろん薬を盗んだ事はありませんし、辞めた人にその話をすると「え？そんな現場見たことないし、注意した事もない」と言ってくれました。

先週、私だけが呼ばれ、会社が用意した12／25で退職と書かれた退職届けと無断コピーして損害を与えた旨が書かれた書類にサインさせられました。朱肉も持参され、その場で書く様に言われました。
辞めたい気持ちがあったし、穏便に事を済ませたいから書いたら刑事告訴はしないと言われサインしました。
ただ、今月私とAさんだけ給料が発生しない公休(調整休)が2日入っていました。
その代わりパートさんのシフトが増えています。

そして今日、朝礼の時、「あれほどインターネットには接続しないように言ってたのにアクセスし履歴をわざわざ消した跡があると報告をうけた。今回は、解雇を、考えています」と言われました。
みんな「使えなくしたんじゃなかった？」って言うくらい寝耳に水の話しで困惑してます。
また、新しい看護師を即雇用したので、難癖つけられて辞めさせられそうな気がします。
(今まで解雇された人達も同じ様な感じだったので)
見に覚えがないのでハッキリ伝えましたが、
もし警察に被害届けが出され刑事告訴された場合私はどうなってしまうのでしょうか？
またシフトを減らされたり解雇されても仕方ないのでしょうか